- Dirección Técnica
- Dirección Centro de Atención Ciudadana
- Dirección Administrativa y Financiera
- Dirección de Tecnologías de la Información (TI)
- Dirección de Planificación y Desarrollo
- Dirección de Estudios, Investigación y Estrategia de Gobierno Electrónico
- Departamento de Estandarización, Normativas y Auditoría Técnica
- Departamento de Recursos Humanos
- Departamento Jurídico
- Departamento de Comunicaciones
- Departamento de Relaciones Interinstitucionales
- Departamento de Relaciones Internacionales
- Oficina de Libre Acceso a la Información (OAI)